現地の市町村は義援金についても口座※を設けていますので、直接振り込むのが肝要かと思います。
http://www.chiginkyo.or.jp/pdf_data/09_notice/saigai_155.pdf
一部しか渡さないという手口の者は、各種団体だって事務手続き費用は差し引いているということを根拠に正当化しているそうです。
上記の口座は、振込手数料すら無料となっています。
※ 銀行口座は、悪意のある個人が詐欺目的で、最もらしい口座名を設けている場合もありますので、これについても御注意ください。